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<!DOCTYPE html>

<title>Nukleotidsequenz</title>

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<h1 id="firstHeading" class="firstHeading mw-first-heading"><span class="mw-page-title-main">Nukleotidsequenz</span></h1>

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</div>

<p>Die <b>Nukleotidsequenz</b> ist die Abfolge der <a href="Nukleotid" class="mw-redirect" title="Nukleotid">Nukleotide</a> einer <a href="Nukleins%C3%A4ure" class="mw-redirect" title="Nukleinsäure">Nukleinsäure</a>, üblicherweise <a href="Desoxyribonukleins%C3%A4ure" title="Desoxyribonukleinsäure">Desoxyribonukleinsäure</a> (DNS, <a href="Englische_Sprache" title="Englische Sprache">englisch</a> <span lang="en">DNA</span>) oder <a href="Ribonukleins%C3%A4ure" title="Ribonukleinsäure">Ribonukleinsäure</a> (RNS, englisch <span lang="en">RNA</span>). Deren verschiedene Grundbausteine (<a href="Desoxyribonukleotide" title="Desoxyribonukleotide">Desoxyribonukleotide</a> bzw. <a href="Ribonukleotide" title="Ribonukleotide">Ribonukleotide</a>) sind gewöhnlich unverzweigt im <a href="Biopolymer" title="Biopolymer">Polymer</a> verkettet und enthalten unterschiedliche <a href="Nukleinbasen" title="Nukleinbasen">Nukleinbasen</a>. Die Sequenz seiner Nukleotide gibt die <a href="Prim%C3%A4rstruktur" title="Primärstruktur">Primärstruktur</a> eines <a href="Polynukleotid" class="mw-redirect" title="Polynukleotid">Polynukleotides</a> wieder und wird für DNA- oder RNA-Einzelstränge jeweils angegeben durch die Abfolge ihrer Nukleinbasen, die <b>Basensequenz.</b>

</p><p>Bei der Notation werden für die <a href="Nukleinbasen" title="Nukleinbasen">Nukleinbasen</a> der Nukleotide die Anfangsbuchstaben ihrer Bezeichnungen verwendet: für <a href="Adenin" title="Adenin">Adenin</a> A, <a href="Guanin" title="Guanin">Guanin</a> G, <a href="Thymin" title="Thymin">Thymin</a> T, <a href="Uracil" title="Uracil">Uracil</a> U und <a href="Cytosin" title="Cytosin">Cytosin</a> C. Bei der DNA kommen die vier Basen Adenin, Guanin, Thymin und Cytosin vor, bei der RNA die vier Basen Adenin, Guanin, Uracil und Cytosin.

</p><p>Übereinkunftsgemäß wird die Basensequenz vom <a href="5%E2%80%B2-Ende" class="mw-redirect" title="5′-Ende">5′-Ende</a> zum <a href="3%E2%80%B2-Ende" class="mw-redirect" title="3′-Ende">3′-Ende</a> des Stranges notiert, in der gleichen Richtung 5′→3′, in der die <a href="Polymerase" class="mw-redirect" title="Polymerase">Polymerase</a> die Nukleinsäure aus Nukleotiden synthetisiert.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Bestimmung">Bestimmung</h2></div>

<div class="hauptartikel" role="navigation"><span class="hauptartikel-pfeil" title="siehe" aria-hidden="true" role="presentation">→ </span><i><span class="hauptartikel-text">Hauptartikel</span>: <a href="DNA-Sequenzierung" title="DNA-Sequenzierung">DNA-Sequenzierung</a> und <a href="RNA-Sequenzierung" title="RNA-Sequenzierung">RNA-Sequenzierung</a></i></div>

<p>Die Nukleotidsequenz einer DNA bzw. wird durch <a href="DNA-Sequenzierung" title="DNA-Sequenzierung">DNA-Sequenzierung</a> respektive <a href="RNA-Sequenzierung" title="RNA-Sequenzierung">RNA-Sequenzierung</a> ermittelt. Basensequenzen von DNA werden unter anderem in großen öffentlichen <a href="Sequenzdatenbank" title="Sequenzdatenbank">Sequenzdatenbanken</a> wie z. B. <a href="GenBank" title="GenBank">GenBank</a> gespeichert.<sup id="cite_ref-1" class="reference"><a href="#cite_note-1"><span class="cite-bracket">[</span>1<span class="cite-bracket">]</span></a></sup> RNA wird nicht direkt sequenziert. Stattdessen wird sie mittels <a href="Reverse_Transkriptase" title="Reverse Transkriptase">Reverser Transkriptase</a> in eine DNA (<a href="CDNA" title="CDNA">cDNA</a>) kopiert, die dann sequenziert wird.<sup id="cite_ref-2" class="reference"><a href="#cite_note-2"><span class="cite-bracket">[</span>2<span class="cite-bracket">]</span></a></sup>

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Statistische_Analyse">Statistische Analyse</h2></div>

<p>Dargestellt als Symbolfolge lassen sich Basensequenzen von DNA oder RNA gut untersuchen. <a href="Statistik" title="Statistik">Statistische</a> Untersuchungen können beispielsweise die Häufigkeit sogenannter <i>n</i>-<a href="Tupel" title="Tupel">Tupel</a> in der Sequenz vergleichen, also das Vorkommen von Teilfolgen der Länge <i>n</i>. So taucht im menschlichen Genom zum Beispiel die Folge <span style="font-family:monospace;">CG</span> bzw. das Tupel (C,G) insgesamt deutlich seltener als eines der anderen fünfzehn 2-Tupel auf (<a href="CG-Suppression" title="CG-Suppression">CG-Suppression</a>). Lokale und regionale <a href="H%C3%A4ufigkeitsverteilung" title="Häufigkeitsverteilung">Häufigkeitsverteilungen</a> verschiedener Nukleotidfolgen können auch erste Hinweise auf eventuelle Funktionen bestimmter DNA-Abschnitte geben. So wird bei <span style="font-family:monospace;">CG</span> beispielsweise nach Häufungen der <a href="CpG-Dinukleotid" title="CpG-Dinukleotid">CpG-Dinukleotide</a> im DNA-Strang gesucht, den sogenannten <a href="CpG-Insel" title="CpG-Insel">CpG-Inseln</a>, und deren <a href="DNA-Methylierung" title="DNA-Methylierung">Methylierungsmuster</a> untersucht. In diesem Fall wird ein aus zwei Basen geformtes <a href="Sequenzmotiv" title="Sequenzmotiv">Sequenzmotiv</a> gesucht.

</p><p>Nach Drei-Basen-Sequenzmotiven wird gesucht, wenn mögliche <a href="Startcodon" title="Startcodon">Startcodons</a> oder <a href="Stopcodon" title="Stopcodon">Stopcodons</a> dargestellt werden sollen. Beispiele für etwas längere Sequenzen sind die möglichen Bindungsstellen für <a href="Ribosom" title="Ribosom">Ribosomen</a>, wie die <a href="Shine-Dalgarno-Sequenz" title="Shine-Dalgarno-Sequenz">Shine-Dalgarno-Sequenz</a> bei <a href="Prokaryoten" title="Prokaryoten">prokaryoten</a> oder die <a href="Kozak-Sequenz" title="Kozak-Sequenz">Kozak-Sequenz</a> bei <a href="Eukaryoten" title="Eukaryoten">eukaryoten</a> Lebewesen. Bestimmte Nukleotidsequenzen spielen auch für den <a href="Terminator_(Genetik)" title="Terminator (Genetik)">Terminator</a> der Transkription eine wichtige Rolle, wie ebenso für den Startpunkt, an dem eine <a href="RNA-Polymerase" class="mw-redirect" title="RNA-Polymerase">RNA-Polymerase</a> mit der Transkription beginnt, beispielsweise in der Promotorregion eines Gens die <a href="TATA-Box" title="TATA-Box">TATA-Box</a>.

</p>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Siehe_auch">Siehe auch</h2></div>

<ul><li><a href="Prim%C3%A4rstruktur" title="Primärstruktur">Primärstruktur</a></li>

<li><a href="Sequenzalignment" title="Sequenzalignment">Sequenzalignment</a></li></ul>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Weblinks">Weblinks</h2></div>

<div class="sisterproject" style="margin:0.1em 0 0 0;"><div class="noresize noviewer" style="display:inline-block; line-height:10px; min-width:1.6em; text-align:center;" aria-hidden="true" role="presentation"><span class="mw-default-size" typeof="mw:File"><span title="Commons"></span></span></div><b><span class=""><a class="external text" href="https://commons.wikimedia.org/wiki/Category:Nucleic_acid_sequence?uselang=de"><span lang="en">Commons</span>: Nukleotidsequenz</a></span></b> – Sammlung von Bildern, Videos und Audiodateien</div>

<div class="mw-heading mw-heading2"><h2 id="Einzelnachweise">Einzelnachweise</h2></div>

<li id="cite_note-1"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-1">↑</a></span> <span class="reference-text">D. A. Benson, K. Clark, I. Karsch-Mizrachi, D. J. Lipman, J. Ostell, E. W. Sayers: <i>GenBank.</i> In: <i>Nucleic acids research.</i> Band 43, Januar 2015, S. D30–D35, <a href="https://doi.org/10.1093/nar/gku1216" class="extiw external" title="doi:10.1093/nar/gku1216">doi:10.1093/nar/gku1216</a>. <a class="external mw-magiclink-pmid" rel="nofollow" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25414350?dopt=Abstract">PMID 25414350</a>, <a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4383990/">PMC 4383990</a> (freier Volltext).</span>

</li>

<li id="cite_note-2"><span class="mw-cite-backlink"><a href="#cite_ref-2">↑</a></span> <span class="reference-text">F. Ozsolak, P. M. Milos: <cite style="font-style:italic">RNA sequencing: advances, challenges and opportunities</cite>. In: <cite style="font-style:italic">Nature Reviews. Genetics</cite>. <span style="white-space:nowrap">Band<span style="display:inline-block;width:.2em"> </span>12</span>, <span style="white-space:nowrap">Nr.<span style="display:inline-block;width:.2em"> </span>2</span>, Februar 2011, <span style="white-space:nowrap">S.<span style="display:inline-block;width:.2em"> </span>87–98</span>, <a href="Digital_Object_Identifier" title="Digital Object Identifier">doi</a>:<span class="uri-handle" style="white-space:nowrap"><a rel="nofollow" class="external text" href="https://doi.org/10.1038/nrg2934">10.1038/nrg2934</a></span>, <a class="external mw-magiclink-pmid" rel="nofollow" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/21191423?dopt=Abstract">PMID 21191423</a>, <a rel="nofollow" class="external text" href="https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3031867/">PMC 3031867</a> (freier Volltext).<span class="Z3988" title="ctx_ver=Z39.88-2004&rft_val_fmt=info%3Aofi%2Ffmt%3Akev%3Amtx%3Ajournal&rfr_id=info:sid/de.wikipedia.org:Nukleotidsequenz&rft.atitle=RNA+sequencing%3A+advances%2C+challenges+and+opportunities&rft.au=F.+Ozsolak%2C+P.+M.+Milos&rft.date=2011-02&rft.doi=10.1038%2Fnrg2934&rft.genre=journal&rft.issue=2&rft.jtitle=Nature+Reviews.+Genetics&rft.pages=87-98&rft.pmc=3031867&rft.pmid=21191423&rft.volume=12" style="display:none"> </span></span>

</li>

</ol></div><div><div class="zim-footer">

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